Doel

Verwerven van basale programmeervaardigheden met behulp van de programmeertaal R, met als hoofdoel om de vertaalstap van biologisch probleem naar geprogrammeerde oplossing te leren maken.

Omschrijving

Verwerven van basale programmeervaardigheden met behulp van de programmeertaal R

Voorkennis

Er is geen specifieke voorkennis vereist.

Onderwijsvorm

Hoorcollege met aansluitende werkgroepen en/of computerpracticum.
De werkgroepen hebben als doel het oefenen in het formuleren en programmeren van een algoritmische oplossing van een probleem. Voor het maken van deze oplossingen zal gebruik worden gemaakt van het softwarepakket R.
Programmeren is een discipline die je pas goed leert door hem toe te passen. Daarom krijgt het praktisch werken meer aandacht dan hoorcollege's over de theorie.

Toetsing

Een tentamen met gestructureerde open vragen, van eenzelfde type als de werkgroepsommen. Het eindcijfer voor elk blok zal worden samengesteld uit het werkgroepcijfer (20%) en het tentamencijfer (80%), met dien verstande dat het eindcijfer niet lager kan zijn dan het tentamencijfer.

Studiemateriaal

In beginsel alleen de syllabus, en de (antwoorden op de) werkgroep opdrachten.

Bij gelegenheid zal via deze webstek, dan wel Blackboard, aanvullend materiaal worden verstrekt.

R

Tijdens dit college zal gebruik worden gemaakt van de taal R. We gebruiken R ook bij de colleges Statistiek-1 en Modelleren, en in het tweede jaar bij de cursus Statistiek-2.

R is een gratis verkrijgbaar softwarepakket, dat voor vele platforms beschikbaar is (Windows, Mac OSX, Linux), en vrij eenvoudig is te installeren op de door 1e jrs studenten Biologie gebruikte laptops.

1. Ga naar de website van R, en kies daar onder de kop Download and Install R het gewenste platform [Windows]
2. Kies in het daarop volgende venster voor: base - Binaries for base distribution
3. Klik in het daarop volgende venster met de rechter muisknop op de link R-2.7.1-win32.exe, en kies Save link as...
4. Kies in het daarop volgende dialoogvenster een geschikte plek om deze file te saven [desktop?], en klik vervolgens Save
5. Ga [met behulp van Windows Explorer] naar de ge-downloade file, en dubbelklik deze om de installatie te starten.
6. Na afloop van de installatie heeft R een shortcut op de desktop geinstalleerd, waarmee het programma gestart kan worden.

Je kunt ook deze link gebruiken om R voor Windows te downloaden; doe daarna stap 5 en 6.